ftract_dev / ImaGIN2 · Issues

Fixed by Anthony 22 feb 2021. Commit aedb8927 : Fix how to manage ', p, - in electrode label.

Il y avait en fait 2 soucis:

1) Un mélange de channels avec des ' et des p qui étaient mal interprétés. Par exemple, selon la convention F-Tract, A'1 et Ap1 doivent être transformés en Ap01 et AP01, mais au lieu de ça le code générait deux fois Ap01 d'où l'erreur "Multiple monopolar channels with the same label found" durant le calcul du montage bipolaire.

2) Un autre souci, qui n'a pas généré d'erreurs, provient du fait que certaines channels dans le .csv s'appellent par exemple "T-TH01" avec un tiret ce qui ne respecte pas la convention F-Tract et donc il n'y a pas eu de correspondances avec le fichier SPM dans lequel il va systématiquement manquer les coordonnées pour ces channels. J'ai également corrigé ce souci mais je ne suis pas sûr que ça soit le comportement souhaité.

Les fix modifient les fichiers SPM du CRF (correction des noms des channels + coordonnées manquantes) et il faut donc faire un Rollback et il faudra refaire le quality control.

Relance steps "Convert" to "BadChannels" 25 feb 2021 -> Despite RollBack=True, only the new Crop are displayed on the Crop validation web page!

Fixed by @anthonyboyer in 8883f903

Reassigned to @chantelb

Re-processing OK from "Convert" to "BadChannels" steps with Rollback=True and .txt/.csv files deletion - 18/05/2021.

Ready to be validated in the https://f-tract.eu:85/ftqualitycontrol/crop/0009MAR/ webpage.

Reassigned to @davido

mentioned in issue https://gin11-git.ujf-grenoble.fr/ftract_dev/ft_pipeline/issues/135

Status changed to closed

Same error for:

0004MIL, 0007MIL, 0039MIL, 0047MIL, 0077MIL

To be reprocessed and revalidated...

Status changed to reopened

Reassigned to @jedynakm

Reassigned to @chantelb

0004MIL - step Electrodes - error : Duplicated label found: c3

Reassigned to @anthonyboyer